Биодизель и его производство - это одно из самых перспективных и выгодных направлений для малого бизнеса, оно позволяет получать высокие прибыли, при этом сохраняется благоприятная экологическая среда. По данным отчета «Технологии и оборудование по производству биодизельного топлива», подготовленного МА «Навигатор», биодизель, при попадании в воду не причиняет вреда растениям и животным. Кроме того, он подвергается практически полному биологическому распаду: в почве или в воде микроорганизмы за 28 дней перерабатывают 99% биодизеля, что позволяет говорить о минимизации загрязнения рек и озёр.
Во-вторых, при сгорании биодизеля выделяется ровно такое же количество углекислого газа, которое было потреблено из атмосферы растением, являющимся исходным сырьём для производства масла, за весь период его жизни. Биодизель в сравнении с обычным дизельным топливом почти не содержит серы. Это хорошо с точки зрения экологии.
В-третьих, точка воспламенения для биодизеля превышает 100 °С, что позволяет назвать биотопливо относительно безопасным веществом. Цикл производства практически безотходный. После производства биотоплива остается жмых, который используют в качестве корма для животных и глицериновая фаза, которая при очистке превращается в чистый глицерин.
Производство биодизеля позволяет ввести в оборот не используемые земли, создать новые рабочие места в сельском хозяйстве, машиностроении, строительстве и т. д. Например, в России только с 1995 г. посевные площади сократились более чем на 25 млн гектаров. Эти огромные площади можно использовать для выращивания биодизельного топлива.