Помимо легального частного рынка медицинских услуг, существует теневой рынок платных услуг. В основном это врачи, работающие в государственных учреждениях и оказывающие услуги за деньги в обход оформления каких либо юридических документов и уплаты налогов. Так теневой рынок платных медицинских услуг по данным был оценен в 100 млрд рублей в 2006 г. Если учитывать темп роста медицинского рынка 18-20% в год, то в 2007 году это рынок мог составить 118-120 млрд рублей. Весь рынок платных услуг в 2007 году оценивается в 245 млрд рублей.
Аналитики компании Synopsis отмечают, что теневые платные услуги в государственных учреждениях связаны более всего с такими видами услуг как диагностика, хирургические вмешательства, родовспоможение редкие виды услуг, как например, в области андрологии, иммунологии, психиатрии, и других. Большую долю в теневых платных услугах занимает родовспоможение. Многие эксперты сходятся во мнении, что это не менее 30% всего теневого платного медицинского рынка.